AI-NGS 單元列表

透過次世代定序(NGS)的協助下，在基礎醫學研究而發表文章的甚多，已成為基因體學及臨床醫學不可或缺的研發輔助工具，經常使用的定序方法有全外顯子體定序(Whole Exome Sequencing)、 轉錄體定序(RNA sequencing)、微小RNA分析(Small RNA Sequencing)以及16S rRNA總體基因體定序(16S metagenomics sequencing)…等等。

利用次世代定序探究關節炎(arthritis)

我們都知道關節炎大致上有分為退化性關節炎(Osteoarthritis; OA)以及類風溼性關節炎rheumatoid arthritis (RA)，在高雄醫學大學研究團隊分別提出"Systematic Analysis of Transcriptomic Profile of Chondrocytes in Osteoarthritic Knee Using Next-Generation Sequencing and Bioinformatics"以及"Systematic Analysis of Differential Expression Profile in Rheumatoid Arthritis Chondrocytes Using Next-Generation Sequencing and Bioinformatics Approaches"分別發表在J Clin Med. 2018 Dec 10;7(12). pii: E535以及Int J Med Sci. 2018 Jul 13;15(11):1129-1142。在同樣部位軟骨细胞(chondrocyte)，退化性關節炎(Osteoarthritis; OA)的結果推測SMAD family member 3 (SMAD3)和Wnt family member 5A (WNT5A)在血管和細胞聚集的增長，代表軟骨損傷的特徵；然而，類風溼性關節炎rheumatoid arthritis (RA)的結果則是發現fibroblast growth factor 9 (FGF9)、kynureninase (KYNU)和regulator of cell cycle (RGCC)則是被推測為可能受RA關節微環境影響的嚴重失調基因，而文章中退化性關節炎與類風溼性關節炎兩項研究皆是透過次世代定序技術找尋影響性的基因與微小核糖核酸群，在透過大數據分析及基因表現資料庫Gene Expression Omnibus(GEO)的比對篩選後，提出影響關節發炎的關鍵性發病機制，提供了嶄新的標靶治療觀點。除此，該研究團隊亦提出Deduction of Novel Genes Potentially Involved in Osteoblasts of Rheumatoid Arthritis Using Next-Generation Sequencing and Bioinformatic Approaches，文中主要發現在RA的成骨細胞(osteoblasts)，A-kinase anchoring protein 12 (AKAP12)以及leucin rich repeat containing 15 (LRRC15)扮演重要角色，此研究發表在Int J Mol Sci. 2017 Nov 11;18(11). pii: E2396。其研究結果顯示miR-183-5p-AKAP12和miR-146a-5p-LRRC15的miRNA與基因交互作用路徑，參與到類風溼性關節炎的微環境中成骨細胞功能的改變，是造成骨侵蝕發生的部分原因。目前的研究結果提出新的候選基因作為評估標靶治療趨化性和新血管形成的治療的潛在指標。在退化性關節炎亦又在synoviocytes有所發現，該研究團隊發現miR-141-3p-LPP 的交互作用提出Identification of Novel Genes in Osteoarthritic Fibroblast-Like Synoviocytes Using Next-Generation Sequencing and Bioinformatics Approaches發表在Int J Med Sci 2019; 16(8):1057-1071。該研究結果顯示利用Ingenuity Pathway Analysis分析發現失調的LPP基因參與了細胞遷移和細胞擴散機制，可能是受miR-141-3p的調節關鍵影響，因此提出了纖維樣滑膜細胞(fibroblast-like synoviocytes, FLS)在退化性關節炎中發病機制的新觀點，可作為潛在標靶治療參考依據。而異常的類風濕性關節炎滑膜成纖維細胞rheumatoid arthritis synovial fibroblasts (RASF)被活化的分子機制資訊仍然不夠透徹，因此高雄醫學大學研究團隊提出Differential Expression Profiles of the Transcriptome and miRNA Interactome in Synovial Fibroblasts of Rheumatoid Arthritis Revealed by Next Generation Sequencing發表在Diagnostics 2019, 9(3), 98，其利用正常人與RA患者的滑膜成纖維細胞(synovial fibroblasts)，透過次世代定序與生物資訊分析，解析兩細胞RNA轉錄體與微小核糖核酸之間的分子機轉途徑進行探討，在透過大數據的剖析下，功能註解分析闡述了RASF的代謝失調與致癌特徵結果，並找到FOXO1關鍵性轉錄因子影響RASF的轉錄體，並驗證了三種miRNA和相應靶標基因（hsa-miR-31-5p：WASF3，hsa-miR-132-3p：RB1，hsa-miR-29c-3p：COL1A1）中的差異表達結果。這些新發現可對異常滑膜成纖維細胞活化的病理生理學得到更全面性的了解，以及滑膜成纖維細胞在導致RA的過程中作用的機制。

利用次世代定序觀察缺氧環境下細胞分子機制調節作用

動脈粥樣硬化症與心肌梗塞是心血管疾病導致死亡重要原因，而在缺氧的條件下心肌細胞會走向細胞凋亡途徑。目前已有研究提出缺氧環境下的心肌細胞中促進細胞凋亡與抗凋亡基因表達的變化，但人類心肌細胞遺傳調控機制是複雜的，尚有許多未闡明的部分。因此高雄醫學大學研究團隊提出Deduction of novel genes potentially involved in hypoxic AC16 human cardiomyocytes using next-generation sequencing and bioinformatics approaches.發表在Int J Mol Med. 2018 Nov;42(5):2489-2502，利用次世代定序技術鑑定在缺氧環境下的AC16心肌細胞，其差異表達的基因與微小核糖核酸，在透過miRmap、TargetScan及miRDB大數據資料庫的整合交集分析，鑑定出兩種潛在的miRNA-mRNA交互作用機制，這些發現提供了在缺氧環境下的心肌細胞新的診斷或治療策略及重要見解。其研究結果還提出了一種重要的新方法，用於探究急性缺氧病理生理學。關於缺氧環境的影響性，值得一提的是缺氧下造成腎癌惡化的影響基因結果，同時高雄醫學大學也提出了Systematic Analysis of Transcriptomic Profile of Renal Cell Carcinoma under Long-Term Hypoxia Using Next-Generation Sequencing and Bioinformatics.發表在Int J Mol Sci. 2017 Dec 7;18(12). pii: E2657.作者們利用次世代定序觀察短期缺氧與長期缺氧下的腎癌細胞基因表達的情況，其研究結果顯示長期缺氧的狀況下會促進癌細胞的群落形成與轉移能力，並且誘導癌細胞增生、腫瘤壞死因子途徑及基底細胞癌等途徑的基因表達失調，因此對於缺氧條件下的細胞影響性提出潛在分子機制及提供了新的思考方向。

利用次世代定序探索糖尿病腎病變治療的標靶分子

糖尿病腎病變(Diabetic nephropathy,DN)是導致腎臟疾病末期的主要原因，主要是糖尿病腎病變會影響到系膜細胞(mesangial cell)的丟失與腎功能的惡化現象，而血管生成素（Angpt）/ Tie配體 - 受體系統在受到干擾後會導致發炎現象和血管生成異常，然而，血管生成素-2(Angpt 2)在系膜細胞中的致病作用仍然未知，因此高雄醫學大學研究團隊提出了Angpt2 Induces Mesangial Cell Apoptosis through the MicroRNA-33-5p-SOCS5 Loop in Diabetic Nephropathy發表於Mol Ther Nucleic Acids. 2018 Dec 7;13:543-555，他們發現的第二型的糖尿病患者與db / db小鼠血清中Angpt2水平有升高的現象，並與白蛋白尿症狀有關，結果顯示Angpt2在高葡萄糖的協同誘導下會促進系膜細胞走向凋亡，並提出細胞分子機制中指標性的基因與微小核糖核酸，可為將來預測腎功能不全與糖尿病腎病變治療的應用參考。而該團隊又進一步的提出The Interaction of miR-378i-Skp2 Regulates Cell Senescence in Diabetic Nephropathy，發表於J Clin Med. 2018 Nov 22;7(12). pii: E468，其發現近端腎小管上皮細胞(Proximal tubular epithelial cell, PTEC)在糖尿病患者初期會有損傷的現象，後續的影響則會導致腎功能衰竭，而細胞衰老參與糖尿病腎病變的病理生理學，作用機制仍不清楚，因此該團隊進行了一項跨學科研究，包括人體、體內和體外的研究，以探索糖尿病腎病變中PTEC細胞衰老的新分子機制，發現高濃度的葡萄糖透過p53和p27的基因表現與週期素E水平的降低，誘導PTEC細胞走向衰老現象。並透過次世代定序和系統生物學的分析，於人類檢體與小鼠動物實驗驗證分析，找到高濃度葡萄糖影響細胞衰老過程中，關鍵影響的基因與微小核糖核酸，提出了miR-378i和Skp2之間的相互作用調節了糖尿病腎病變的PTEC細胞衰老作用，可做為預測糖尿病腎病變損傷的指標參考，更可作為醫療人員針對於腎功能不全的治療與預測應用。

其他有關NGS/Bioinformatics研究方面

高醫研究團隊陸續發表，他們發現The interaction of 4 miRNAs (hsa‑miR‑34a‑5p, hsa‑miR‑34c‑5p, hsa‑miR‑708‑5p, and hsa‑miR‑1271‑5p) and 5 genes (MET, CACNB3, TNS3, TTYH3, and HBEGF) was proposed to participate in the LTA‑induced signaling network. The present findings may provide novel information for understanding the detailed expression profiles and potential networks between miRNAs and their target genes in LTA‑stimulated healthy neutrophils發表在Int J Mol Med. 2019 ;44(4):1436-1446。 除此，在子宮內膜癌，亦證實the analyses using Human Protein Atlas, identified 6 genes (PEG10, CLDN1, ASS1, WNT7A, GLDC, and RSAD2) significantly associated with poorer prognosis and 3 genes (SFN, PIGR, and CDKN1A) significantly associated with better prognosis. Combining with the data of microRNA profiles using microRNA target predicting tools, two significantly dysregulated microRNA-mediated gene expression changes in endometrial adenocarcinoma were identified: downregulated hsa-miR-127-5p with upregulated CSTB and upregulated hsa-miR-218-5p with downregulated HPGD. These findings may contribute important new insights into possible novel diagnostic or therapeutic strategies for endometrial adenocarcinoma發表於Int J Med Sci 2019; 16(10):1338-1348.

從基礎醫學走向轉譯醫療與精準醫療

從高雄醫學大學在2019年發表在Int J Mol Sci期刊的Deducting MicroRNA-Mediated Changes Common in Bronchial Epithelial Cells of Asthma and Chronic Obstructive Pulmonary Disease-A Next-Generation Sequencing-Guided Bioinformatic Approach文章中，可以發現在臨床醫師與基礎醫學教授的合作下，他們利用次世代定序分析氣喘與慢性阻塞性肺病(COPD)的細胞株，在數據剖析後得到可能影響致病機制的基因與小分子核糖核酸(microRNA)群，進而利用即時聚合酶連鎖反應（qPCR）技術於氣喘患者、慢性阻塞性肺病患者及健康受試者檢體進行驗證，揭露了可能引起發病機轉的關鍵性小分子核糖核酸(microRNA)。此研究其相關於Int J Chron Obstruct Pulmon Dis. 2018 Aug 10;13:2387-2398、Pathol Res Pract. 2018 Sep;214(9):1489-1496、Oncotarget. 2017 Jul 31;8(47):82674-82688，此確實是「從實驗室到病床」(Bench to Bedside) ，不僅為「轉譯醫療」(Translational Medicine)，更甚為「精準醫療」(Precision Medicine)。

How AI and next-generation genomic sequencing is helping Idiopathic Pulmonary Fibrosis (IPF)?

特發性肺纖維化（IPF）是一種致命的疾病，被認為是沉默的非癌殺手，五年存活率僅約20-40％，因為初期症狀不明顯，常被誤診為成哮喘、心臟疾病、環境引起的過敏性肺炎、塵肺症等。目前關於特發性肺纖維化的引發疾病的細胞與分子機制資訊仍有不足的情況，而人工智慧與次世代定序要如何協助特發性肺纖維化(IPF)的病人呢?這問題似乎在高雄醫學大學能有所回應，其研究團隊率先提出Bioinformatic analysis of next‑generation sequencing data to identify dysregulated genes in fibroblasts of idiopathic pulmonary fibrosis發表於Int J Mol Med. 2019 Apr;43(4):1643-1656，其透過次世代定序分析IPF患者肺纖維細胞與正常人肺纖維細胞基因表達差異，找到調節失常的潛在基因群後，又在Gene Expression Omnibus（GEO）數據庫中進行分析與驗證，最後找到影響IPF纖維細胞於miRNA-mRNA間交互作用的潛在關係，進而闡述了影響細胞增殖與存活的關鍵基因，其結果改善了目前纖維細胞作為IPF發病機制的資訊。又以Gene Expression Changes Associated with Nintedanib Treatment in Idiopathic Pulmonary Fibrosis Fibroblasts: A Next-Generation Sequencing and Bioinformatics Study發表於J Clin Med. 2019 Mar 5;8(3). pii: E308，闡述關於Nintedanib酪氨酸激酶抑製劑目前使用於IPF的治療，已被認為能夠對於纖維細胞的增殖、遷移以及肌成纖維細胞轉化有抑制作用，但其中基因調控的機轉尚未有系統性的研究，因此他們透過次世代定序分析經Nintedanib不同濃度處理的IPF纖維細胞，發現了與Nintedanib治療相關的13種潛在miRNA-mRNA相互作用關係，更進一步於miRDB、TargetScan資料庫比對分析及RT-qPCR技術驗證，鑑定出可能影響肺纖維細胞增殖降低及IPF的微環境下血管生成降低現象的關鍵性基因與微小核糖核酸。有趣的是進一步發現The Effects of Epigallocatechin Gallate (EGCG) on Pulmonary Fibroblasts of Idiopathic Pulmonary Fibrosis (IPF)-A Next-Generation Sequencing and Bioinformatic Approach發表於Int J Mol Sci. 2019 Apr 22;20(8). pii: E1958，研究團隊利用綠茶兒茶素Epigallocatechin Gallate (EGCG)抗氧化、抗發炎與抗纖維化的特性，首度利用次定代定序觀察兒茶素對於IPF肺纖維細胞基因表達的影響，他們觀察到兒茶素會參與調節膽固醇的生成與代謝反應，並提出利用EGCG治療特發性肺纖維化潛在的關鍵基因與微小核糖核酸分子，其結果提供了醫療人員評估利用EGCG於特發性肺纖維化治療中的潛在益處及科學依據參考，並值得進一步去了解在特發性肺纖維化發病機制中膽固醇於體內平衡的分子途徑作用。以上皆呈現利用NGS-Bioinformatics，探究特發性肺纖維化疾病（Idiopathic Pulmonary Fibrosis，IPF）的影響基因及標靶藥物的機制，甚至深入探討綠茶成份的綠茶兒茶素Epigallocatechin Gallate (EGCG)能預防特發性肺纖維化疾病（ Idiopathic Pulmonary Fibrosis，IPF）的機轉，給予醫療相關人員作為治療建議的參考依據。因此這些發現或許可以解答How AI and next-generation genomic sequencing is helping Idiopathic Pulmonary Fibrosis (IPF)的問題。

從高雄醫學大學研究團隊所發表NGS-Bioinformatics的文章內容，似乎是採取自我發展，從作者群可看出來自不同科別的醫師，卻能自由探索自己專科的興趣、從臨床走到基礎，發掘了臨床醫師對研究熱情。除此，NGS-Bioinformatics的確能提供大數據，這在接收大量資訊是很有幫助的，然而，若沒有建構有體系的思考能力下，讓資訊垃圾進垃圾出（garbage in and garbage out），反而令無法完成論文發表。在20餘篇論文中可看出其指導者，在國際上還沒發表之前，先主動提出來，並指導與帶領成員，同時也要挑起完全的責任，賦予權力讓團隊去執行，讓不同科別的醫師一併同行，整個群體方能有所論文發表的成果。有如同行致遠！因為，作者群們相互協助，go far, go together！

在次世代定序所產出的大數據(多組龐大的數據匯集)，當今最需要利用人工智慧程序的協助的是進行序列分析、基因變異分析、基因輔助診斷、基因體資料註解、致病性預測、及文獻比對作業，進而提出引發疾病的預測及醫療診斷。然而，目前次世代基因定序結果的判讀，是透過傳統生物資訊學的架構下分析，尚無法因應完善的智慧醫療協助，並且目前科學研究累積的遺傳疾病資訊、藥物反應與癌症基因體都有大量的數據成果，因此導入人工智慧的程序協同數據判斷與疾病預測將可強化目前的醫療工具。

綜合本文所收集到的國際期刊文章中，我們可以發現高雄醫學大學、高雄醫學大學附設中和紀念醫院、高雄長庚醫院、國立中山大學...等等學術與醫療單位，所發表NGS-Bioinformatics的文章內容裡，作者群為來自不同科別的醫師與基礎學科教授合作，在研究團隊努力下，已從基礎醫學至臨床醫學方向邁進，目前已累積相當龐大NGS研究成果資料，倘若能夠在人工智慧的輔助下，讓跨院所與跨科別的醫療人員能夠使用智慧醫療程序進行數據判斷與分析，則能夠促進個人化醫療與精準醫學的發展。因此對於醫學研究資料的累積，以及深度學習架構下的人工智慧分析系統建構，已成為國家發展最重要的利器。

然而，這些在醫療上的大數據，不論是幾十萬比，抑或幾百萬筆的資料，透過AI人工智慧，抑或稱之智慧醫療，經過NGS-bioinformatics分析，雖節省時間、成本、繁雜過程，但是最終仍必需依靠著”人”要具細心、耐心及用心方能完成分析整理。

國內已使用次世代定序發表國際期刊的文章如下:

轉錄體定序(RNA sequencing)與微小RNA分析(Small RNA Sequencing)

Identification of novel genetic regulations associated with airway epithelial homeostasis using next-generation sequencing data and bioinformatics approaches.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29137293
學術與醫療單位: 高雄醫學大學、高雄醫學大學附設中和紀念醫院

Deduction of Novel Genes Potentially Involved in Osteoblasts of Rheumatoid Arthritis Using Next-Generation Sequencing and Bioinformatic Approaches.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29137139
學術與醫療單位: 高雄醫學大學、高雄醫學大學附設中和紀念醫院、高雄市立大同醫院、國立中山大學

Identification of novel gene expression signature in lung adenocarcinoma by using next-generation sequencing data and bioinformatics analysis.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29285217
學術與醫療單位: 高雄醫學大學、高雄醫學大學附設中和紀念醫院、國立中山大學

Systematic Analysis of Transcriptomic Profile of Renal Cell Carcinoma under Long-Term Hypoxia Using Next-Generation Sequencing and Bioinformatics.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29215599
學術與醫療單位: 高雄醫學大學、高雄醫學大學附設中和紀念醫院、國立中山大學

Identification of novel genes in aging osteoblasts using next-generation sequencing and bioinformatics.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29371932
學術與醫療單位: 高雄醫學大學、高雄醫學大學附設中和紀念醫院、義大癌治療醫院、義守大學、國立中山大學

Systematic Analysis of Differential Expression Profile in Rheumatoid Arthritis Chondrocytes Using Next-Generation Sequencing and Bioinformatics Approaches.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30123050
學術與醫療單位: 高雄醫學大學、高雄醫學大學附設中和紀念醫院

Systematic analysis of transcriptomic profiles of COPD airway epithelium using next-generation sequencing and bioinformatics.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6089098/
學術與醫療單位: 高雄醫學大學、高雄醫學大學附設中和紀念醫院

Possible Mechanisms Mediating Apoptosis of Bronchial Epithelial Cells in Chronic Obstructive Pulmonary Disease – A Next-Generation Sequencing Approach.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30115538
學術與醫療單位: 高雄醫學大學、高雄醫學大學附設中和紀念醫院

Deduction of novel genes potentially involved in hypoxic AC16 human cardiomyocytes using next generation sequencing and bioinformatic approaches.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30226555
學術與醫療單位: 高雄醫學大學

Identification of mutations in SLC4A1, GP1BA and HFE in a family with venous thrombosis of unknown cause by next-generation sequencing.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30344693
學術與醫療單位: 高雄醫學大學、高雄醫學大學附設中和紀念醫院

Angpt2 Induces Mesangial Cell Apoptosis through the MicroRNA-33-5p-SOCS5 Loop in Diabetic Nephropathy.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30414568
學術與醫療單位: 高雄醫學大學、高雄醫學大學附設中和紀念醫院

The Interaction of miR-378i-Skp2 Regulates Cell Senescence in Diabetic Nephropathy.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30469549
學術與醫療單位: 高雄醫學大學、高雄醫學大學附設中和紀念醫院

Systematic Analysis of Transcriptomic Profile of Chondrocytes in Osteoarthritic Knee Using Next-Generation Sequencing and Bioinformatics.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30544699
學術與醫療單位: 高雄醫學大學、高雄醫學大學附設中和紀念醫院、國立中山大學

Deduction of Novel Genes Potentially Involved in Upper Tract Urothelial Carcinoma Using Next-Generation Sequencing and Bioinformatics Approaches.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6332486/
學術與醫療單位: 高雄醫學大學、高雄醫學大學附設中和紀念醫院、國立中山大學

Deduction of Novel Genes Potentially Involved in Keratinocytes of Type 2 Diabetes Using Next-Generation Sequencing and Bioinformatics Approaches.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30634634
學術與醫療單位: 高雄醫學大學、高雄醫學大學附設中和紀念醫院、國立中山大學、國立臺中科技大學

Deducting MicroRNA-Mediated Changes Common in Bronchial Epithelial Cells of Asthma and Chronic Obstructive Pulmonary Disease-A Next-Generation Sequencing-Guided Bioinformatic Approach.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30696075
學術與醫療單位: 高雄醫學大學、高雄醫學大學附設中和紀念醫院

Gene Expression Changes Associated with Nintedanib Treatment in Idiopathic Pulmonary Fibrosis Fibroblasts: A Next-Generation Sequencing and Bioinformatics Study.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6462954/
學術與醫療單位: 高雄醫學大學、高雄醫學大學附設中和紀念醫院

Bioinformatic analysis of next-generation sequencing data to identify dysregulated genes in fibroblasts of idiopathic pulmonary fibrosis.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30720061
學術與醫療單位: 高雄醫學大學、高雄醫學大學附設中和紀念醫院

The Effects of Epigallocatechin Gallate (EGCG) on Pulmonary Fibroblasts of Idiopathic Pulmonary Fibrosis (IPF)-A Next-Generation Sequencing and Bioinformatic Approach.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6514693/
學術與醫療單位: 高雄醫學大學、高雄醫學大學附設中和紀念醫院

Differential expression profiles of the transcriptome in bone marrow derived cells in lung cancer revealed by next generation sequencing and bioinformatics.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6444499/
學術與醫療單位: 高雄醫學大學、高雄醫學大學附設中和紀念醫院、高雄市立聯合醫院

Maternal Fructose Exposure Programs Metabolic Syndrome-Associated Bladder Overactivity in Young Adult Offspring.
https://www.nature.com/articles/srep34669
學術與醫療單位: 高雄長庚紀念醫院

Positive Feedback Loop of OCT4 and c-JUN Expedites Cancer Stemness in Liver Cancer.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27341307
學術與醫療單位: 高雄醫學大學、高雄醫學大學附設中和紀念醫院、高雄市立大同醫院、國立中山大學

Identification of Novel Genes in Osteoarthritic Fibroblast-Like Synoviocytes Using Next-Generation Sequencing and Bioinformatics Approaches.
http://www.medsci.org/v16p1057.htm
學術與醫療單位: 高雄醫學大學附設中和紀念醫院、高雄醫學大學

Differential Expression Profiles of the Transcriptome and miRNA Interactome in Synovial Fibroblasts of Rheumatoid Arthritis Revealed by Next Generation Sequencing.
https://www.mdpi.com/2075-4418/9/3/98/htm
學術與醫療單位: 高雄醫學大學附設中和紀念醫院、高雄市立大同醫院、高雄醫學大學、國立中山大學

Investigating Novel Genes Potentially Involved in Endometrial Adenocarcinoma using Next-Generation Sequencing and Bioinformatic Approaches.
https://www.mdpi.com/1010-660X/55/9/589
學術與醫療單位: 高雄醫學大學附設中和紀念醫院、高雄醫學大學、高雄市立大同醫院、國立中山大學

Next-generation sequencing predicts interaction network between miRNA and target genes in lipoteichoic acid-stimulated human neutrophils.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31432136/
學術與醫療單位: 高雄醫學大學附設中和紀念醫院、高雄醫學大學

Deduction of Novel Genes Potentially Involved in the Effects of Very Low Dose Atropine (0.003%) Treatment on Corneal Epithelial Cells Using Next-Generation Sequencing and Bioinformatics Approaches.
https://www.mdpi.com/1010-660X/55/9/589
學術與醫療單位: 高雄醫學大學附設中和紀念醫院、高雄醫學大學、高雄長庚紀念醫院

全外顯子體定序(Whole Exome Sequencing)

DEPDC5 mutations in familial and sporadic focal epilepsy.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28170089
學術與醫療單位: 高雄長庚紀念醫院、高雄榮民總醫院、高雄醫學大學附設中和紀念醫院、美和科技大學

Application of Next Generation Sequencing in Noninvasive Prenatal Genetic Diagnosis.
https://www.ingentaconnect.com/content/sil/impact/2018/00002018/00000010/art00009#
學術與醫療單位: 彰化基督教醫院、國立台灣大學、大葉大學

參考資料：

圖片來源：